背景介绍:
插入突变体库的建立是一种研究分析生物基因功能的正向遗传学手段。其主要方法为,将一段特定的基因序列随机的整合至宿主基因组中,形成一系列不同的突变体,这些突变体被破坏的基因有所不同,每一个突变体都相当于一个独立的基因敲除株,针对这些突变体进行某些表型的筛选,我们可以确定一系列突变体与某一基因功能相关。通过追踪这些突变体被破坏的基因,我们可以将一系列基因与某一表型联系起来,进而分析某一生物学现象的分子机制。
根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)是一种革兰氏阴性杆菌,在研究过程中发现其中含有一个约 200kbp 的肿瘤诱导质粒(tumor-inducingplasmid,Ti 质粒),它在感染宿主真菌过程中可将其中的一部分 transferDNA(T-DNA)整合到宿主染色体,破坏对应的基因区域。农杆菌介导的真菌遗传转化技术(ATMT)已成功应用于许多丝状真菌基因功能研究,已成功建立了许多丝状真菌的T-DNA插入突变体库,如尖孢镰刀菌,稻瘟病菌,烟曲霉,申克氏孢子丝菌等。利用这些突变体库,已经发现一些与致病,耐药,形态等相关的突变体及其相关基因。ATMT能够用来筛选带有某些特定表型的突变体,进而阐明相关基因功能。
武汉锐志魔方生物具有多年T-DNA随机插入突变体文库构建经验,并通过自主技术研发开发出了快速高效的特定片段侧翼序列鉴定技术,可帮助用户完成建库及鉴定等相关工作。
应用示例:
技术优势:
自主改进了多类真菌遗传转化工具质粒
自有cubes-seq技术可快速鉴定T-DNA片段整合位点
严格的质控标准,确保突变株整合位点的均一性
可实现Tn-seq高通量测序,为突变体文库鉴定提供技术保障
承接菌种汇总:
分类 | 真菌名称 |
酵母选型真菌 | 毕赤酵母 |
酿酒酵母 |
白念珠菌 |
隐球菌 |
阿萨希毛孢子菌 |
马尔尼菲蓝状菌 |
丝状真菌 | 曲霉属 |
青霉属 |
镰刀菌 |
植物炭疽菌 |
大型真菌 | 香菇 |
双孢蘑菇 |
金针菇 |
其他真菌 |
因篇幅有限其他真菌定制突变体库, 请具体咨询 |
参考文献:
【1】Feng J , Li T , Zhang X , et al. Efficient production of polymalic acid from xylose mother liquor, an environmental waste from the xylitol industry, by a T-DNA-based mutant of Aureobasidium pullulans.[J]. Applied microbiology and biotechnology, 2019, 103(16):6519-6527.
【2】Xu L , Chen W . Random T-DNA Mutagenesis Identifies a Cu/Zn Superoxide Dismutase Gene as a Virulence Factor of Sclerotinia sclerotiorum[J]. Molecular Plant-microbe Interactions:MPMI, 2013, 26(4):431-441.
【3】Simon U , Pflug F G , Alexandra S , et al. In vivo insertion pool sequencing identifies virulence factors in a complex fungal–host interaction[J]. Plos Biology, 2018, 16(4):e2005129.
【4】Bo L , Lu Z , Hao L , et al. Use of Random T-DNA Mutagenesis in Identification of Gene UvPRO1, A Regulator of Conidiation, Stress Response, and Virulence in Ustilaginoidea virens[J]. Frontiers in Microbiology, 2016, 7:2086-.
【5】Liu Y , Koh C M J , Yap S A , et al. Identification of novel genes in the carotenogenic and oleaginous yeast Rhodotorula toruloides through genome-wide insertional mutagenesis[J]. Bmc Microbiology, 2018, 18(1):14.
【6】龙南彪. 根瘤农杆菌T-DNA插入介导的烟曲霉耐药突变菌的分子机制[J]. 2021.
【7】刘力伟. 根癌农杆菌介导层出镰刀菌遗传转化及T-DNA侧翼序列的获得[D]. 河北农业大学, 2016.