背景介绍:
转座子(transposon)是一类可以自主位移并插入宿主基因组中随机位点的移动遗传因子,这种转位特性使它可以直接或间接地造成基因重排,引起基因变异。
随着许多微生物基因组全序列的获得,人们对微生物关注和研究的热点已经从结构基因组学转移到功能基因组学,在大量的分子遗传研究方法中,转座子随机诱变技术因操作简便易行而备受关注。
支原体是一类微小的细菌,其特殊之处在于它们不具备细胞壁,而是由一个三层结构的细胞膜包裹着。支原体通常需要寄生在其他细胞内进行生长和繁殖,因此也被称为内生菌。
目前可用于支原体基因遗传操作的体系非常有限,仅转座子Tn916和Tn4001可用于支原体的转化,其中Tn916存在插入热点,因此不适合用于支原体的转座子突变体库构建。Tn4001是4.5Kb的复合型转座子,含有庆大霉素/卡那霉素/妥布霉素的抗性基因,已被成功用于多种支原体物种的转化。
由于目前并无有效方法直接构建支原体目标基因的缺失突变株,因此从转座子突变体库中筛选目标基因的插入失活株,几乎是获得支原体敲除株的唯一手段。这也增加了支原体突变体库构建的意义,不仅用于目标表型功能基因的挖掘,也可以通过PCR检测找出目标基因的突变株。
以德国哥廷根大学普通微生物学系为例,该实验室于2006年首次建立了肺炎支原体M129的转座子突变体库,其后以该文库为基础发表了多篇高因子文章,加快了支原体功能机制及基因研究的进度。
技术优势:
国内首家提供高质量转座子随机插入突变体文库构建的公司
自主改进了多类转座子工具质粒(Himar1/Tn5/Tn4351等)
大量革兰氏阳性菌突变体库构建经验
自有cubes-seq技术可快速鉴定转座片段整合位点
严格的质控标准,确保突变株整合位点的均一性
可实现Tn-seq高通量测序,为突变体文库鉴定提供技术保障
锐志魔方生物现推出多类细菌的现货himar1转座子突变体文库,技术成熟、交付周期短、质控标准高,用户可放心选购。
参考文献:
【1】Zhu X , Baranowski E , Dong Y , et al. An emerging role for cyclic dinucleotide phosphodiesterase and nanoRNase activities in Mycoplasma bovis: Securing survival in cell culture[J]. PLoS Pathogens, 2020, 16(6):e1008661.我司承担完成支原体突变株转座子整合位点鉴定工作。
【2】Yamamoto T , Kida Y , Sakamoto Y , et al. Mpn491, a secreted nuclease of Mycoplasma pneumoniae, plays a critical role in evading killing by neutrophil extracellular traps[J]. Cellular Microbiology, 2016, 19(3).
【3】Shaw D , Miravet-Verde S , Pinero C , et al. LoxTnSeq: Random Transposon insertions combined with cre/lox recombination and counterselection to generate large random genome reductions. Cold Spring Harbor Laboratory, 2020.
【4】Blötz C, Singh N, Dumke R, et al. Characterization of an immunoglobulin binding protein (IbpM) from Mycoplasma pneumoniae[J]. Frontiers in microbiology, 2020, 11: 685.