真菌沉默株构建

当目标真菌缺乏高效的 CRISPR/Cas9 体系、同源重组效率极低,或靶基因为生长必需基因无法直接敲除时,RNAi 基因沉默是理想替代方案。锐志魔方利用根癌农杆菌介导转化(ATMT)结合双向启动子载体,构建可稳定遗传的真菌沉默株。

一、RNAi 沉默的适用场景

  • 目标菌株同源重组效率低,CRISPR 体系难以建立;
  • 靶基因为必需基因,完全敲除致死;
  • 需要可调控、可恢复的表达下调,用于功能剂量研究;
  • 多基因家族成员冗余,需同时下调多个同源基因。

二、典型构建流程

真菌沉默株构建流程
图 1 双孢蘑菇沉默株构建流程:双向启动子发夹载体构建 → 农杆菌转化 → 真菌共培养 → 抗性筛选 → qPCR 验证沉默效率。

三、可承接真菌类群

分类可承接真菌
酵母型真菌毕赤酵母、酿酒酵母、白念珠菌、隐球菌、阿萨希毛孢子菌、马尔尼菲蓝状菌
丝状真菌曲霉属、青霉属、镰刀菌、植物炭疽菌
大型真菌香菇、双孢蘑菇、金针菇等
其他具体可咨询定制

四、交付标准

  • qPCR 检测目标基因表达量下降 ≥70%;
  • 表型验证(如适用);
  • 阳性克隆甘油菌与实验报告。

五、参考文献

  • Chao-Jun M A, Gang-Zheng W, Sha-Sha Z, et al. Functional analyses of anthranilate synthase gene LetrpE in Lentinula edodes by RNAi mediated gene knockdown. Mycosystema, 2018.
  • Sun X, Wu H, Zhao G, et al. Morphological regulation of Aspergillus niger to improve citric acid production by chsC gene silencing. Bioprocess and Biosystems Engineering, 2018, 41: 1029-1038.
  • 张芙蓉. 犬小孢子菌丝氨酸水解酶 FSH1 的功能及亚细胞定位研究. 大连医科大学, 2023.
  • 梁涛. RNA 干扰曲霉菌 ALP、PLB 基因表达治疗真菌性角膜炎的实验研究. 青岛大学, 2010.