微生物突变体文库构建
微生物突变体文库是功能基因组学研究的基础资源。锐志魔方整合细菌转座子、支原体 Tn4001 与真菌 T-DNA 三大建库平台,结合 cubes-seq 插入位点快速鉴定与 Tn-seq 高通量测序,为客户提供从建库、筛选到基因定位的一站式解决方案。
一、平台技术路线对比
| 文库类型 | 适用对象 | 插入元件 | 主要用途 |
|---|---|---|---|
| 细菌转座子突变体库 | 革兰氏阴性/阳性细菌、厌氧菌 | Himar1 / Tn5 / Tn4351 | 全基因组功能基因筛选、必需基因网络、致病性研究 |
| 支原体转座子突变体库 | 肺炎支原体、牛支原体等 | Tn4001 | 类敲除表型筛选、致病机制、药物靶点发现 |
| 真菌 T-DNA 突变体库 | 丝状真菌、大型真菌、酵母型真菌 | 农杆菌 T-DNA | 致病、耐药、形态、代谢与食用性状改良 |
二、服务流程
- 需求评估:目标菌种、库容量、筛选表型;
- 载体构建:根据菌种选择转座子/T-DNA 载体与抗性标记;
- 转化与筛选:电转化 / ATMT / 原生质体转化,获得覆盖全基因组的高质量文库;
- 文库质控:随机挑取克隆进行插入位点鉴定,评估覆盖度与均一性;
- 表型筛选与定位:根据客户需求开展耐药、致病、代谢等表型筛选,结合 cubes-seq 或 Tn-seq 定位关键基因。
三、交付内容
- 突变体文库甘油菌或孢子库;
- 文库覆盖度与随机性评估报告;
- 插入位点鉴定数据(cubes-seq / Tn-seq);
- 候选突变体单克隆与基因型验证报告。