转座子突变体库构建与 cubes-seq 插入位点鉴定

分类:突变体库 | 标签:cubes-seq

项目背景

客户需构建大规模随机突变体文库,用于解析基因功能、筛选关键表型。传统全基因组重测序定位插入位点成本高、周期长,难以支撑高通量筛选。

技术路线

  1. 突变体库构建:根据菌株特性选择 mariner/Tn5 等转座子系统,构建覆盖度足够的随机插入突变体库。
  2. 单克隆挑取与保存:自动化挑取单克隆并建立 96 孔板保存体系。
  3. 插入位点鉴定:以自主研发的 cubes-seq 技术替代常规重测序,快速、低成本确定转座子插入位点。
  4. Tn-Seq 分析:结合表型筛选与插入位点统计,定位候选关键基因。

交付成果

  • 覆盖度达标的高质量转座子突变体库
  • 单克隆库与插入位点鉴定报告
  • cubes-seq 数据与 Tn-Seq 分析结果
  • 突变体鉴定成本与周期显著下降,高效锁定目标基因

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